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    宏基因組測序

    宏基因組測序

    • 所屬分類:NGS技術服務
    • 瀏覽次數:
    • 發布日期:2021-03-30 15:58:04
    • 產品概述
    • 案例解析

    宏基因組 ( Metagenome)(也稱微生物環境基因組Microbial Environmental Genome, 或元基因組)是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名詞,即環境中全部微生物遺傳物質的總和。
    宏基因組學(Metagenomics),一般指通過直接從特定生態環境樣品中提取全部微生物的DNA,進行高通量測序分析,研究環境微生物的群落結構、物種分類、系統進化、基因功能、代謝網絡及與其所在的生態環境間的互作情況等的一門學問。


    技術路線

    宏1.png
    測序策略

    2.png



    樣本要求

    3.png



    生信分析

    4.png



    部分數據展示

    數據質量評估:

    5.png
    菌群分布結果:

    6.png



    物種豐度熱圖:

    7.png



    KEGG分類結果:

    8.png



    服務周期

    樣本質控合格后30個工作日


    參考文獻

    [1]Petersen Lauren M,Bautista Eddy J,Nguyen Hoan,Hanson Blake M,Chen Lei,Lek Sai H,Sodergren Erica,Weinstock George M. Community characteristics of the gut microbiomes of competitive cyclists.[J]. Microbiome,2017,5(1).

    [2]Xiong Xuejian,Bales Elise S,Ir Diana,Robertson Charles E,McManaman James L,Frank Daniel N,Parkinson John. Perilipin-2 modulates dietary fat-induced microbial global gene expression profiles in the mouse intestine.[J]. Microbiome,2017,5(1).

    [3]Cookson William O C M,Cox Michael J,Moffatt Miriam F. New opportunities for managing acute and chronic lung infections.[J]. Nature reviews. Microbiology,2018,16(2).

    [4]Gu W, Miller S, & Chiu CY. Clinical Metagenomic Next-Generation Sequencing for Pathogen Detection. Annual Review of Pathology: Mechanisms of Disease,2018.

    [5]Hu Hui-Li,Guo Ling-Yun,Wu Hong-Long,Feng Wen-Ya,Chen Tian-Ming,Liu Gang. Evaluation of next-generation sequencing for the pathogenic diagnosis of children brain abscesses.[J]. The Journal of infection,2019.


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