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    mRNA轉錄組測序

    mRNA轉錄組測序

    • 所屬分類:NGS技術服務
    • 瀏覽次數:
    • 發布日期:2021-01-04 15:17:56
    • 產品概述
    • 案例解析

    產品簡介
    普通轉錄組測序就是對特定物種或者特定細胞在某一功能狀態下產生的所有mRNA進行的測序。將生物樣本中的RNA反轉錄為cDNA,構建測序文庫,利用二代測序平臺得到序列,進行生物信息學分析;全面快速地獲得某一物種特定組織在某一狀態下的所有轉錄本。

    糖基化蛋白質組學


    M1.png
    技術路線

    注:真核生物采用Oligo dT磁珠富集法,原核生物采用去rRNA法來富集mRNA。


    技術優勢

    檢測不受物種限制
    不依賴于參考基因組,對于無參基因組的物種也可以進行轉錄組測序以及后續分析

    檢測范圍廣泛
    可直接對任意物種進行轉錄組測序,可以同時鑒定己知的、稀有低豐度的和新的轉錄本

    高質量數據產出
    實驗過程中嚴格按照質控標準,保證數據可靠性。測序結果到單個堿基,可檢測到由可變剪切造成的單個堿基差異。

    資深的生信分析團隊 
    測序數據可被用來分析基因表達差異,基因功能分析以及鑒定新的轉錄木信息以及個性化分析

    優質的一站式股務
    專業的技術團隊為您提供1V1的一站式服務,讓您時刻了解項目動態。 
    2.png
    測序策略

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    樣本要求

    數據分析
    根據測序物種有無參考基因組可以分為有參轉錄組測序和無參轉錄組測序。分別可以得到的生信分析如下:
    4.png

    有參轉錄組測序生信分析


    5.png

    無參轉錄組測序生信分析


    部分數據展示
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    組間的差異基因Venn 圖

    7.png

    差異表達基因聚類熱圖

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    樣品PCA 分析圖

    9.png


    差異基因GO Terms 富集結果top20 散點圖



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    服務周期:樣本質控合格后30個工作日


    相關文獻

    [1]Huang Yingmei,Chen Huiqiong,Reinfelder John R,Liang Xiaoyu,Sun Chongjun,Liu Chuanping,Li Fangbai,Yi Jicai. A transcriptomic (RNA-seq) analysis of genes responsive to both cadmium and arsenic stress in rice root.[J]. The Science of the total environment,2019,666.

    [2]Kundu Anirban,Singh Pankaj Kumar,Dey Avishek,Ganguli Sayak,Pal Amita. Complex molecular mechanisms underlying MYMIV-resistance in Vigna mungo revealed by comparative transcriptome profiling.[J]. Scientific reports,2019,9(1).

    [3]Yan Yong-Wei,Zou Bin,Zhu Ting,Hozzein Wael N,Quan Zhe-Xue. Modified RNA-seq method for microbial community and diversity analysis using rRNA in different types of environmental samples.[J]. PloS one,2017,12(10).

    [4]Peng Wu,Shuo Yang,Sandeep Singh,Fujun Qin,Shailesh Kumar,Ling Wang,Ding Ma,Hui Li. The Landscape and Implications of Chimeric RNAs in Cervical Cancer[J]. EBioMedicine,2018,37.


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